O produtor Michael Bay ("Transformers") prometeu que a origem das Tartarugas Ninjas seria fiel ao universo já conhecido dos personagens. Também se cogitou sobre uma origem alienígena. Mas para a surpresa de muitos, a sinopse final aparenta trazer algumas mudanças ao dos quadrinhos (então adaptados para os desenhos e para o cinema) eliminando a possível hipótese de um acidente.